Медербек Айтмырзаев поступил в Юридический Колледж при Кыргызской Государственной Юридической Академии (КГЮА) в 2009 году. В 2012 году окончил колледж с красным дипломом. С 2012 по 2015 год учился в КГЮА на факультете международного права. В 2015 году Медербек окончил КГЮА с присвоением степени дипломированного юриста. В студенческие годы он проходил практику в Первомайском Районном Суде города Бишкек, в адвокатуре Свердловского Районного Суда города Бишкек и в Министерстве Труда, Миграции и Молодежи Кыргызской Республики.

В 2015 году выиграл стипендиальную программу «Турецкие Стипендии» и приехал в Турцию для обучения на магистратуре. С 2015 по 2016 год изучал турецкий язык на подготовительных курсах при Анкарском Университете. В 2016-2018 годах проходил магистерскую программу на факультете Политологии (кафедра Права Человека) при Анкарском Университете. По окончании обучения защитил магистерскую диссертацию на тему «Независимость и Беспристрастность Судей в Контексте Права на Справедливое Судебное Разбирательство в Кыргызстане». Медербек, обучаясь в Турции, принимал участие в таких учебных семинарах и научных конференциях как, Закон и Права Человека (SETA), Международная Торговля (MUSİAD), Учение о Праве и Политологии (YTB) и Учение Политологии Тюркоязычного Мира (Türk Parlamenterler Vakfı). Он также стажировался в Ближневосточном Исследовательском Центре ORSAM в Анкаре. В настоящее время Медербек является консультантом в Юридическом Бюро Сейхан.

Медербек владеет кыргызским, турецким, русским и английским языками.